一部中国部队电影，里面有一位女计算机博士懂木马病毒，最后控制导弹返航，成功完成训练任务

你问应该是《无懈可击》。CCTV6的官网电影网上就有，可以点播。

剧情是

西北某战区，一场旨在检验和提高我军协同作战的高技术合成演习“07任务”，进入最后二十四小时倒计时。演习导演部总指挥向全体参演部队发布命令前，指挥所信息中心指挥系统发现有“黑客”入侵。“黑客”通过远程控制，已经完全进入“07任务”，指挥部发布的所有命令将受到来自“黑客”的干扰和破坏。