我在香港开房、大陆公安系统有记录吗？

这个应该是不会有记录的，因为你没有存在在一个地方。应该是查询不到。处在其他地方的一些记录的。

身份证能查我在酒店开的房记录查询吗？

绝对不能，个人是没有权力去查询宾馆的记录。

关于宾馆入住记录，是宾馆直接和公安部门联网的，这意味着只有公安部门才能查询到某个人的身份证使用情况或者入住情况；家用电脑无论怎么样也无法查询入住记录，已经个人是没有户籍系统。